医院创建于1952年，系国家卫生健康委预算管理单位、三级甲等医院，是集医、教、研、防、管为一体的综合性儿童专科医院，是全国儿科学重点学科、国家“211”、“985”和“双一流”工程建设单位，2017年获批国家儿童医学中心。

国家儿童医学中心的定位及愿景

医院定位：立足上海、服务全国、辐射亚洲、走向世界

医院愿景：国际一流的儿童医学中心

学科建设

我院经过70年的发展，医院学科综合实力领先，临床专科优势突出。拥有一批国家级重点学科和平台，包括：7个国家临床重点专科（新生儿、重症医学科、小儿消化科、中医儿科、新生儿疾病重点实验室、小儿外科、临床护理）；4个卫生部临床学科重点专业（新生儿、外科、心血管、传染病）；国家新生儿先天性心脏病筛查项目管理办公室；国家儿科专业医疗质量控制中心；国家高通量基因临床诊断基地；国家远程医疗与互联网医学中心儿科协同中心；国家卫生部新生儿疾病重点实验室；国家住院医生规范化培训重点专业基地（儿科）；国家新生儿特色保健专科基地。

省部级重点学科和平台（15个）有：上海市“重中之重”临床医学中心（儿科）；上海市“重中之重”临床重点学科（儿科学）；上海市“重中之重”临床重点学科（儿外科）；上海市小儿外科疑难病诊治中心；上海市公共卫生重点发展专业（小儿传染病）；上海市新生儿会诊抢救中心；上海市新生儿先心病筛查诊治中心；上海市儿科临床质量控制中心；上海市新生儿质控中心；上海市新生儿先心病筛查质控与督导中心；上海市出生缺陷防治重点实验室；上海市肾脏发育与肾脏疾病研究中心。